Не изобретайте колесо. Если бизнес-процессы компании в основном укладываются в типовые решения и требуют только корректировки и настройки, то за основу необходимо взять такое готовое решение и доработать нужный функционал.
Если требуется какой-то уникальный программный продукт, аналога которому нет у 1С и партнеров, либо переработка аналога значительно изменит конфигурацию, то наиболее правильным решением будет
создать конфигурацию «с нуля».
При окончательном принятии решения необходимо взвесить все «за» и «против» типового решения и написанного «с нуля».